Mengapa plasmid yang terkandung dalam bakteri Agrobacterium tumefaciens disebut plasmid Ti

Full PDF PackageDownload Full PDF Package

This Paper

A short summary of this paper

24 Full PDFs related to this paper

Download

PDF Pack

Enung Sri Mulyaningsih

Di era transformasi genetik sekarang ini, peran Agrobacteriumtumefaciens (Agrobacterium) sangat besar dalam menghasilkan tanaman yang dimodifikasi untuk mendapatkan sifat yang diinginkan. Peran Agrobacterium dalam hal ini ialah sebagai kendaraan pembawa gen (DNA) yang diinginkan. A. tumefaciens merupakan bakteri aerob obligat gram negatif yang hidup alami di tanah. Bakteri ini banyak menyebabkan penyakit crown gall (tumor) pada tanaman dikotil. Kemampuannya dalam menyebabkan penyakit ini berhubungan dengan gen penginduksi tumor yang ada pada plasmid (Ti) yang dijumpai dalam bakteri tersebut. Dalam sel tumor yang terbentuk terkandung enzimenzim yang tidak tampak pada tanaman normal, karena enzim tersebut hanya dihasilkan oleh sel Agrobacterium. Enzim-enzim tersebut menghasilkan suatu senyawa gula spesifik yang dinamakan opin. Senyawa opin ini merupakan makanan bagi Agrobacterium itu sendiri.

Saat ini tidak ada refbacks.

Biotrends Indexed By :

Statistic Counter

Page 2

Enung Sri Mulyaningsih

Saat ini tidak ada refbacks.

Biotrends Indexed By :

Statistic Counter

Page 3

Cover Depan Biotrends Vol 4 No 1 (2009)

Sekilas Layanan Peminjaman Perpustakaan Puslit Bioteknologi LIPI

Cover Belakang Biotrends Vol 4 No 1 (2009)

Biotrends Indexed By :

Statistic Counter

Agrobacterium tumefaciens adalah bakteri patogen terhadap tanaman dikotil. Jika suatu tanaman dikotil terinfeksi oleh bakteri ini maka akan terbentuk tumor yang disebut crown gall. Kemampuan membentuk tumor ditentukan oleh plasmid Ti yang ada dalam A. tumefaciens. Plasmid Ti mengandung suatu fragmen DNA yang disebut T-DNA (berukuran 15-30 kb) yang dapat diintegrasikan ke dalam DNA inti sel tanaman. Oleh karena itu plasmid Ti selanjutnya dikembangkan sebagai vektor untuk memasukkan DNA asing ke dalam sel tanaman.

Proses rekayasa genetika dilakukan dengan terlebih dahulu mengisolasi DNA yang akan disisipkan. DNA asing disisipkan ke dalam vektor plasmid Ti sehingga akan terjadi rekombinasi pada fragmen T-DNA pada plasmid Ti. Plasmid Ti dimasukkan kembali ke dalam A. tumefaciens. Pada waktu A. tumefaciens menginfeksi sel tanaman, plasmid Ti rekombinan akan mengintegrasikan bagian T-DNA ke dalam DNA inti sel tanaman. Dengan demikian DNA asing tersebut akan ikut terintegrasikan ke dalam genom tanaman. Rekayasa genetika dengan menggunakan plasmid Ti dapat dilihat sebagai berikut.

Agrobacterium tumefaciens Agrobacterium tumefaciens yang sedang meninfeksi sel wortel. Klasifikasi ilmiah Domain:

Bacteria

Filum:

Proteobacteria

Kelas:

Alphaproteobacteria

Ordo:

Hyphomicrobiales

Famili:

Rhizobiaceae

Genus:

Agrobacterium

Spesies:

A. tumefaciens

Nama binomial Agrobacterium tumefaciens[1][2]

(Beijerinck and van Delden 1902) Conn 1942 (Approved Lists 1980)

Strain tipe ATCC 23308[3]

B6
CFBP 2413
HAMBI 1811
ICMP 5856
LMG 187
NCPPB 2437

Sinonim

Bacterium tumefaciens Smith and Townsend 1907
Pseudomonas tumefaciens (Smith and Townsend 1907) Duggar 1909
Phytomonas tumefaciens (Smith and Townsend 1907) Bergey et al. 1923
Polymonas tumefaciens (Smith and Townsend 1907) Lieske 1928

Agrobacterium tumefaciens adalah bakteri patogen pada tanaman yang banyak digunakan untuk memasukkan gen asing ke dalam sel tanaman untuk menghasilkan suatu tanaman transgenik.[4] Bakteri ini dipopulerkan oleh Mary-Dell Chilton sejak tahun 1977 melalui penelitiannya. Secara alami, A. tumefaciens dapat menginfeksi tanaman dikotiledon melalui bagian tanaman yang terluka sehingga menyebabkan tumor mahkota empedu (crown gall tumor).[4] Bakteri yang tergolong ke dalam gram negatif ini memiliki sebuah plasmid besar yang disebut plasmid-Ti yang berisi gen penyandi faktor virulensi penyebab infeksi bakteri ini pada tanaman.[5] Untuk memulai pembentukan tumor, A. tumefaciens harus menempel terlebih dahulu pada permukaan sel inang dengan memanfaatkan polisakarida asam yang akan digunakan untuk mengkoloniasi/menguasai sel tanaman.[4] Selain tanaman dikotiledon, tanaman monokotiledon seperti jagung, gandum, dan tebu telah digunakan untuk memasukkan sel asing ke dalam genom tanaman.[4] Agrobacterium tumefaciens adalah bakteri patogen pada tanaman yang banyak digunakan untuk memasukkan gen asing ke dalam sel tanaman untuk menghasilkan suatu tanaman transgenik.[4]

^ Sawada H, Ieki H, Oyaizu H, Matsumoto S. (1993). "Proposal for rejection of Agrobacterium tumefaciens and revised descriptions for the genus Agrobacterium and for Agrobacterium radiobacter and Agrobacterium rhizogenes". Int J Syst Bacteriol. 43 (4): 694–702. doi:10.1099/00207713-43-4-694  . PMID 8240952. Pemeliharaan CS1: Menggunakan parameter penulis (link)
^ Judicial Commission (compiled by Tindall BJ). (2014). "Judicial Opinion No. 94: Agrobacterium radiobacter (Beijerinck and van Delden 1902) Conn 1942 has priority over Agrobacterium tumefaciens (Smith and Townsend 1907) Conn 1942 when the two are treated as members of the same species based on the principle of priority and Rule 23a, Note 1 as applied to the corresponding specific epithets". Int J Syst Evol Microbiol. 64 (Pt 10): 3590–3592. doi:10.1099/ijs.0.069203-0  . PMID 25288664. Pemeliharaan CS1: Menggunakan parameter penulis (link)
^ This is contested: Velazquez E, Flores-Felix JD, Sanchez-Juanes F, Igual JM, Peix A. (2020). "Strain ATCC 4720T is the authentic type strain of Agrobacterium tumefaciens, which is not a later heterotypic synonym of Agrobacterium radiobacter". Int J Syst Evol Microbiol. 70 (9): 5172–5176. doi:10.1099/ijsem.0.004443  . PMID 32915125. Pemeliharaan CS1: Menggunakan parameter penulis (link)
^ a b c d e (Inggris)Gustavo A. de la Riva, Joel González-Cabrera, Roberto Vázquez-Padrón, Camilo Ayra-Pardo (1998). "Agrobacterium tumefaciens: a natural tool for plant transformation". EJB Electronic Journal of Biotechnology. 1 (3). doi:10.2225/vol1-issue3-fulltext-1. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2010-03-28. Pemeliharaan CS1: Banyak nama: authors list (link)
^ (Inggris)Madigan MT, Martinko JM, (2000). Brock Biology of Microorganisms. Prentice Hall. ISBN 978-0-13-081922-2.Page.989